「臺北醫學大學飛洋國際服務團（TMU FLYoung International Service）」的前身「臺灣大專生海外服務團（Taiwan Universities Service Overseas；TUSO）」成立於2003年10月；臺灣醫療援外先鋒、第六屆醫療奉獻獎得主－郭惠二教授因有感於臺灣大專生缺乏國際視野，且對於第三世界充滿迷信與誤解，故仿「加拿大大學海外服務團（Canadian University Service Overseas；CUSO）」與時為臺北醫學大學醫學系學生的劉美芳共同努力成立了「臺灣大專生海外服務團」，為臺灣第一個以落實海外服務、親身造訪第三世界國家，旨於發揚人道及服務精神、學習異文化和拓展自我地球村視野的學生志工團體；除於每年寒暑假舉辦「臺灣大專生海外醫療衛生服務研習會（營）」外，至今更已協助數百名臺灣大專生前往非洲馬拉威、史瓦濟蘭王國、南印度流亡藏人社區、泰北等地從事醫療、公共衛生、教育、研究工作。

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2003年至2008年，臺灣大專生海外服務團長期與台灣基督教長老教會台北大安教會、屏東基督教醫院臺灣駐馬拉威醫療團合作，每年派遣服務隊前往馬拉威進行義診及衛教，或至馬拉威北部姆祖祖中央醫院（Mzuzu Central Hospital）見實習並協助相關醫療衛生計畫的推動；2008年馬拉威與我國斷交，計畫因此而中斷。2006年起，海外服務團與臺北醫學大學牙醫學系合作，開啟了南印度流亡藏人社區牙科服務計畫，由本校牙醫學系教授及牙醫學生所組成的團隊，定期前往南印度進行牙科診療、口腔衛教的服務。

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2008年，馬拉威與我國斷交；同年，為配合我國國際醫療政策，臺北醫學大學結合旗下三家附屬醫院：臺北醫學大學附設醫院、臺北市立萬芳醫院以及衛生福利部雙和醫院的醫療資源，與財團法人國際合作發展基金會簽定駐史瓦濟蘭王國醫療服務合約，2009年起由神經外科杜繼誠醫師出任團長，開始了長駐於史瓦濟蘭王國的醫療服務。2009年，當時的臺北醫學大學校長邱文達（前衛生福利部部長）及寄生蟲學科范家堃主任，親自帶領考察團及研究團隊至史國從事研究，海外服務團亦自行募款組隊一同前往，協助義診、衛教、寄生蟲篩檢等相關工作，成果豐碩，甚至發表了數篇國際熱帶醫學學術論文。

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2010年至2011年，有了2009年的經驗與借鏡，海外服務團改以臺北醫學大學校內招生為主，同時結合校內「國際志工與醫療合作」通識課程，讓團員在出發前便能夠建構一定的熱帶醫學、跨文化溝通、人類學、國際援助等相關知識與能力。延續2009年的寄生蟲篩檢工作，2010年更增加了營養研究計畫，調查當地飲食習慣、食物類別，進行愛滋病營養學學術探討、營養教育等，希望能提升史瓦濟蘭王國國民的飲食健康觀念。2011年，除持續的偏遠地區義診服務、寄生蟲及營養研究計畫外，為使團員的活動及觸角能更加多元，海外服務團開始與史國當地機構或國際組織合作，至史國偏遠地區進行社區衛教、居民關懷，或是至各地區孤兒院為孩童進行基本身體健康檢查、口腔塗氟、衛生教育及康樂活動等，甚至實際參與了史國當地愛滋病門診、愛滋病防治計畫，深入了解這個在史國盛行率高居全球第一的重要疾病。

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經過了多年的耕耘，海外服務團逐漸展現出初步成果，2009年至2011年的研究計畫已發表多篇國際論文；與臺灣駐史瓦濟蘭王國醫療團聯合舉辦的史國偏鄉義診服務亦已達數十場、上千人次，更實際參與執行了醫療團所駐點的史國史京醫院（Mbabane Government Hospital；MGH）病歷系統重建計畫、手術室器械管理計畫，獲院方高度肯定與讚揚；與史瓦濟蘭大學所進行的教學合作，亦大幅增加了兩國學生間的交流。2012年起海外服務團與寄生蟲學科、史國國家實驗室、史國衛生部等單位合作，開始進行「史瓦濟蘭王國婦女陰道滴蟲感染率與蟲體攜帶HIV和HPV和其基因型之分子流行病學研究」計畫；2012年底，史瓦濟蘭王國衛生部更優先提名臺北醫學大學為合作夥伴，雙方在我國駐史瓦濟蘭王國蔡明耀大使的見證下，簽訂了2013年後的醫療服務合約。足見臺北醫學大學一校三院，不僅是在學術上的成就，更是台、史兩國邦交鞏固的重要推手。

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2013年，海外服務團堂堂邁入十周年。十年來國際志工服務學習在臺灣蓬勃發展，為求在日益穩固的基礎之上與時俱進並更上一層樓，正式將「臺灣大專生海外服務團」更名為「臺北醫學大學飛洋國際服務團」；2014年首度參加教育部青年發展暑青年志工績優團隊全國競賽便一舉榮獲國際志工類第一名肯定。2015年起，飛洋國際服務團更與「柬埔寨台灣教育計畫（Cambodia-Taiwan Education Program；CTEP）」等組織合作開啟了柬埔寨服務計畫，期許能繼續拓展服務效益與影響力。

未來，飛洋國際服務團目標推動與臺灣各大專院校國際志工服務學習團隊平行交流，深化與國際組織、在地組織的合作，擴大服務面向，並繼續朝
「永續（Sustainable）」、「賦權（Empowerment）」的國際趨勢方向前進。